Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms