Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms