Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms