Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC39A3Q9BRY0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms