Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 CEP250-206ENST00000425525 918 ntTSL 317.8■□□□□ 0.443e-7■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 PLOD3-203ENST00000421736 809 ntTSL 519.33■□□□□ 0.689e-8■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 PLOD3-205ENST00000440925 536 ntTSL 416.28■□□□□ 0.29e-8■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 PLOD3-211ENST00000466881 661 ntTSL 212.66□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.722e-10■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 218.25■□□□□ 0.512e-10■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-10■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-10■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.815e-12■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.625e-12■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.65e-12■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.475e-12■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.455e-12■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 217.45■□□□□ 0.385e-12■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.345e-12■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 NDRG1-227ENST00000523892 562 ntTSL 410.36□□□□□ -0.755e-7■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.132e-7■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.082e-7■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.082e-7■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 225.66■■□□□ 1.72e-7■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)21.39■■□□□ 1.012e-7■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 STK25-222ENST00000465009 871 ntTSL 219.8■□□□□ 0.762e-14■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 STK25-225ENST00000478403 1123 ntTSL 517.82■□□□□ 0.442e-14■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 CYFIP1-214ENST00000622576 583 ntTSL 424.63■■□□□ 1.532e-6■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 TLE1-204ENST00000418319 936 ntTSL 516.64■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 GYS1-204ENST00000472004 578 ntTSL 315.4■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 25.5
BUD13Q9BRD0 FARP2-216ENST00000478489 617 ntTSL 322.69■■□□□ 1.225e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 FARP2-205ENST00000418082 456 ntTSL 411.79□□□□□ -0.525e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 FARP2-208ENST00000445489 538 ntTSL 211.34□□□□□ -0.595e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 FARP2-210ENST00000467260 471 ntTSL 38.78□□□□□ -15e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 FARP2-213ENST00000473082 397 ntTSL 36.1□□□□□ -1.435e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 HYOU1-201ENST00000526354 568 ntTSL 225.44■■□□□ 1.663e-8■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.173e-6■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.11e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.975e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PITX1-206ENST00000507253 587 ntTSL 326.87■■□□□ 1.895e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PITX1-202ENST00000502676 666 ntTSL 326.4■■□□□ 1.825e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.575e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 R3HDM4-202ENST00000586080 537 ntTSL 424.64■■□□□ 1.545e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.425e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.015e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PKD1-209ENST00000472659 661 ntTSL 321.32■■□□□ 15e-8■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NPDC1-204ENST00000485589 506 ntTSL 220.71■□□□□ 0.912e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NPDC1-205ENST00000488145 701 ntTSL 220.5■□□□□ 0.875e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.855e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.825e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.85e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NBEAL2-206ENST00000461036 785 ntTSL 319.93■□□□□ 0.785e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.765e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 THAP3-206ENST00000484669 744 ntTSL 519.29■□□□□ 0.685e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.685e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.675e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NBEAL2-210ENST00000477412 827 ntTSL 218.61■□□□□ 0.575e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NBEAL2-209ENST00000476095 959 ntTSL 518.61■□□□□ 0.575e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.535e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PKD1-236ENST00000568796 447 ntTSL 318.32■□□□□ 0.522e-8■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 B3GNTL1-205ENST00000571394 774 ntTSL 318.13■□□□□ 0.495e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 THAP3-207ENST00000484676 879 ntTSL 517.28■□□□□ 0.365e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.361e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.285e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 THAP3-208ENST00000487819 840 ntTSL 216.61■□□□□ 0.255e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.25e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 THAP3-204ENST00000472925 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.15■□□□□ 0.185e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.115e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 B3GNTL1-208ENST00000572977 2446 ntTSL 215.64■□□□□ 0.095e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 B3GNTL1-209ENST00000573363 471 ntTSL 215.27■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.015e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.185e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NARS2-207ENST00000529880 755 ntTSL 313.86□□□□□ -0.195e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.225e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-208ENST00000546652 823 ntTSL 513.3□□□□□ -0.282e-17■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 B3GNTL1-202ENST00000570947 390 ntTSL 312.92□□□□□ -0.345e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.45e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 512.33□□□□□ -0.445e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-204ENST00000439930 1296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.445e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 MRPS7-206ENST00000583407 864 ntTSL 312.06□□□□□ -0.485e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.495e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.565e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.565e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.585e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 CTC1-202ENST00000449476 4797 ntTSL 211.18□□□□□ -0.625e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.635e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.685e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.685e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.75e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 SEC23B-206ENST00000450074 1184 ntTSL 510.4□□□□□ -0.744e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.815e-11■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.885e-7■■■■□ 25.4
BUD13Q9BRD0 NSD3-209ENST00000528828 1376 ntTSL 1 (best)9.41□□□□□ -0.95e-7■■■■□ 25.4
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