Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms