Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPAT1Q99943 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPAT1Q99943 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPAT1Q99943 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPAT1Q99943 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPAT1Q99943 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPAT1Q99943 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPAT1Q99943 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms