Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX2Q99811 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms