Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms