Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRAMP1Q96RY5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms