Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms