Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD1Q96MW7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms