Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms