Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms