Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms