Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA4Q96DD7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms