Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC74AQ96AQ1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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