Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCG3Q8WXD2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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