Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms