Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A9Q8IVB4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms