Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms