Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SSH2Q76I76 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SSH2Q76I76 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SSH2Q76I76 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SSH2Q76I76 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SSH2Q76I76 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSH2Q76I76 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms