Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms