Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms