Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC70Q6NSX1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms