Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms