Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms