Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms