Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC7AQ5VTJ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms