Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRTP1Q5TC63 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms