Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms