Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VARS2Q5ST30 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VARS2Q5ST30 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms