Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms