Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRDTQ58F21 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRDTQ58F21 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms