Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms