Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC1Q4ZHG4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms