Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTC1Q2NKJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms