Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2B3Q16720 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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