Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK4Q16099 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK4Q16099 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms