Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms