Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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