Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOFQ13790 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOFQ13790 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOFQ13790 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOFQ13790 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOFQ13790 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOFQ13790 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOFQ13790 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOFQ13790 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOFQ13790 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
APOFQ13790 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOFQ13790 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOFQ13790 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOFQ13790 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOFQ13790 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOFQ13790 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOFQ13790 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOFQ13790 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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APOFQ13790 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOFQ13790 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOFQ13790 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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APOFQ13790 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOFQ13790 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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