Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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