Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms