Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RESTQ13127 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RESTQ13127 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RESTQ13127 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RESTQ13127 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RESTQ13127 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RESTQ13127 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RESTQ13127 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RESTQ13127 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RESTQ13127 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RESTQ13127 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RESTQ13127 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RESTQ13127 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RESTQ13127 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RESTQ13127 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RESTQ13127 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RESTQ13127 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RESTQ13127 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RESTQ13127 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RESTQ13127 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RESTQ13127 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RESTQ13127 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RESTQ13127 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RESTQ13127 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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