Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STX4Q12846 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STX4Q12846 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STX4Q12846 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STX4Q12846 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STX4Q12846 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms