Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNA1Q09470 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms