Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3AQ05086 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3AQ05086 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms