Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms