Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL13RA1P78552 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms